शोधकर्ताओं की गति और सरलता

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शोधकर्ताओं की गति और सरलता

यूके में बर्मिंघम विश्वविद्यालय के शोधकर्ताओं ने कोविड -19 के लिए एक उपन्यास, अत्यधिक संवेदनशील परीक्षण पद्धति की गति, सटीकता और सादगी की पुष्टि की है जिसे मनोरंजक स्थानों, हवाई अड्डे के आगमन टर्मिनलों और दूरस्थ सेटिंग्स में तैनात किया जा सकता है जहां नैदानिक ​​​​परीक्षण प्रयोगशालाएं हैं। उपलब्ध नहीं है।

तीन-तरफा तुलना अध्ययन का उपयोग करने वाले वैज्ञानिकों ने पुष्टि की कि एक्सपोनेंशियल एम्प्लीफिकेशन रिएक्शन (EXPAR) विधि अधिक संवेदनशील है, लेकिन पीसीआर और एलएएमपी दोनों परीक्षणों की तुलना में तेज़ है, जो वर्तमान में अस्पताल की सेटिंग में उपयोग किया जाता है। बर्मिंघम कोविड -19 परीक्षण, जिसे RTF-EXPAR कहा जाता है, 10 मिनट से कम का नमूना-से-संकेत समय देता है, यहां तक ​​कि कम वायरल स्तरों के लिए भी जहां वर्तमान साइड फ्लो परीक्षण कम प्रभावी होते हैं।

स्कूल ऑफ बायोसाइंसेज के प्रोफेसर टिम डफर्न और स्कूल ऑफ केमिस्ट्री के जिम टकर, स्नातक छात्र जैक कार्टर और इंस्टीट्यूट ऑफ कैंसर एंड जीनोमिक साइंसेज के प्रोफेसर एंड्रयू बैग्स ने अध्ययन पर काम किया, जिसे आज प्रकाशित किया गया। पीएनएएस.

पीसीआर और एलएएमपी दोनों परीक्षण वायरल आरएनए का पता लगाते हैं, जो मुंह और नाक से लिए गए स्वैब में बेहद निम्न स्तर पर मौजूद हो सकते हैं। ये परीक्षण दो-चरणीय प्रक्रिया का उपयोग करते हैं जिसमें पहले आरएनए को डीएनए में परिवर्तित करना (एक प्रक्रिया जिसे रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन के रूप में जाना जाता है) और फिर सामग्री को कई बार ‘एम्पलीफाइंग’ करना शामिल है ताकि नमूने में इसका पता लगाया जा सके।

प्रोफेसर टिम डफरिन ने कहा: “रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन और एम्प्लीफिकेशन दोनों ही न्यूक्लिक एसिड डिटेक्शन, एंटीजन टेस्ट, जैसे लेटरल फ्लो के आधार पर मौजूदा कोविद एसेज़ को धीमा करते हैं, जिनमें ये उपाय नहीं होते हैं। पीसीआर और एलएएमपी-आधारित परीक्षणों की तुलना में तेज़। वे आमतौर पर कम होते हैं। संवेदनशील। एक आदर्श परीक्षण पर्याप्त संवेदनशील और तेज़ दोनों होता है, आरटीएफ-एक्सपर नामक हमारा परीक्षण इस लक्ष्य को प्राप्त करता है।

RTF-EXPAR ने यह उपलब्धि दो तरह से हासिल की है सबसे पहले टीम ने एक नया RNA-to-DNA रूपांतरण चरण तैयार किया है जो रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन से बचता है, जिससे यह रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन-फ्री (RTF) बन जाता है। दूसरा, उनका प्रवर्धन चरण एक रीड-आउट सिग्नल उत्पन्न करने के लिए EXPAR का उपयोग करता है, जो PCR और LAMP के लिए एक वैकल्पिक डीएनए प्रवर्धन प्रक्रिया है।

प्रोफेसर डेफॉर्न ने कहा: “EXPAR एक ही तापमान पर डीएनए का विस्तार करता है, इस प्रकार पीसीआर में पाए जाने वाले लंबे ताप और शीतलन उपायों से बचता है। हालांकि, LAMP प्रवर्धन के लिए समान तापमान का उपयोग करते समय, EXPAR एक सरल और अधिक सीधी प्रक्रिया है। , जिसमें कई छोटे होते हैं स्ट्रैंड्स एम्प्लीफाइड। यह न केवल पीसीआर बल्कि डीएनए एम्प्लीफिकेशन तकनीक को भी LAMP से तेज बनाता है।”

अध्ययन में पाया गया कि RTF-EXPAR विधि आरएनए के 10 स्ट्रैंड्स के तहत 10 मिनट के भीतर डीएनए की अरबों प्रतियों को परिवर्तित करती है, वर्तमान परीक्षण विधियों की तुलना में अधिक बुनियादी, बेंचटॉप टूल के साथ संगत एक-पॉट परख का उपयोग करती है।

RTF-EXPAR ने समय पर सिग्नल का पता लगाने के लिए PCR और LAMP- आधारित दोनों पर महत्वपूर्ण सुधार दिखाए। आरएनए (7.25 प्रतियां / एल) की कम सांद्रता पर, पीसीआर के लिए सिग्नल का पता लगाने का समय 42.67 (± 0.47) मिनट, लैंप के लिए 11.25 (± 0.20) मिनट और EXPAR के लिए 8.75 (± 0.35) मिनट था। वायरल आरएनए की उच्च (1450 प्रतियां / μL) सांद्रता पर, पीसीआर के लिए सिग्नल का पता लगाने का समय 34.00 (± 0.00) मिनट, लैंप के लिए 11.25 (± 0.20) मिनट और EXPAR के लिए 3.08 (± 0.42) मिनट था।

सर्वोत्तम क्रम की पहचान करना स्पष्ट रूप से EXPAR पद्धति के विकास में एक महत्वपूर्ण कदम था, और अध्ययन में खोजा गया क्रम, जिससे Orf1ab SARS-Covy-2 जीनोम में जीन को कोवे के सभी मौजूदा प्रकारों में संरक्षित दिखाया गया है। हालांकि, नए उपभेदों के उभरने पर, या इन्फ्लूएंजा, रेस्पिरेटरी सिंकाइटियल वायरस (RSV), या इबोला जैसे अन्य वायरल रोगजनकों के परीक्षण के लिए RTF-EXPAR पद्धति को जल्दी से बदला जा सकता है, जहां अधिक व्यापक संचरण को रोकने के लिए करीबी रोगी परीक्षण की आवश्यकता होती है।

परख का परीक्षण बर्मिंघम विश्वविद्यालय में सर्जिकल अनुसंधान प्रयोगशाला में किया गया है। प्रोफेसर एंड्रयू बैग्स, जिनकी टीम ने परीक्षण किया, ने टिप्पणी की: “परीक्षण ने एक महामारी के दौरान देखे जाने वाले वायरल लोड की एक विशिष्ट श्रेणी के साथ एक स्वैब का उपयोग किया, और इसमें छह मिनट का कट-ऑफ समय था। विश्लेषण ने आरटीएफ-एक्सपीएआर के प्रति संवेदनशीलता दिखाई। समतुल्य। मात्रात्मक पीसीआर परीक्षण के लिए, 89% के सकारात्मक भविष्य कहनेवाला मूल्य और 93% के नकारात्मक भविष्य कहनेवाला मूल्य के साथ। हम निकट भविष्य में इस परीक्षण के पूर्ण परिणाम प्रकाशित करने की उम्मीद करते हैं। “

टीम अब RTF-EXPAR परीक्षण को यथासंभव व्यापक रूप से उपलब्ध कराने के लिए त्वरित लाइसेंस के लिए वाणिज्यिक भागीदारों की तलाश कर रही है।

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